Compréhension du mécanisme enzyme-substrat par modélisation moléculaire.

Abstract

La recherche en biologie ne peut, actuellement, se passer des outils informatiques pour traiter les données produites et optimiser ses avancées. L’un de ces outils est la modélisation moléculaire et plus précisément l’arrimage moléculaire (plus souvent connu sous le terme "docking"). L’emploi initial du "docking" moléculaire a été de prédire et reproduire des complexes protéine-ligand. Le docking est la base de la reconnaissance moléculaire et du type d’interaction. À chaque protéine cible de structure connue le docking se révèle être la clé dans le design de nouveaux médicaments. Notre travail consiste à étudier l’inhibition des différentes enzymes impliquées dans la maladie du diabète de type 2 avec des différents inhibiteurs par les méthodes de modélisation moléculaire. Nous avons choisis des programmes du docking moléculaire pour notre travail: Hex6.3, MOE et GOLD.