Conception des amorces encadrant le SNP rs3211908 du gène CD36 associé à l'obésité

Abstract

Introduction : L'obésité est un problème majeur de santé qui peut contribuer au risque de complications métaboliques Des études génétiques récentes suggèrent que CD36 joue un rôle important dans le métabolisme des lipides chez l'homme et peuvent être impliqués dans les complications liées à l'obésité. La protéine CD36 est un récepteur scavenger de classe B. Le CD36 est une glycoprotéine de 472 acides aminés. Le gène CD36 est localisé sur le chromosome 7q1 1.2 chez l'Homme. La protéine est exprimée de manière ubiquitaire sur une variété de types de cellules, y compris les adipocytes, les macrophages, les cellules endothéliales vasculaires et les entérocytes intestinaux. Objectif: L'objectif de ce travail est de concevoir, avec spécificité, le couple d'amorce encadrant le SNP rs321 1908 du gène CD36 associé à l'obésité dans la population européenne. Afin d'étudier son implication dans l'obésité chez la population Algérienne; lors d'études castémoins ultérieures qui ce fait grâce à la PCR. La réaction PCR (Polymerase Chain Réaction) permet d'amplifier in vitro une région spécifique d'un acide nucléique donné afin d'en obtenir une quantité suffisante pour le détecter et l'étudier. Matériels et méthode: L'efficacité et la sensibilité de la PCR dépendent en grande partie sur l'efficacité des amorces Grâce au logiciel primer blast nous avons conçue un couple d'amorce spécifique à la région encadrant le SNP ra 3211908. Résultats: Un couple d'amorces spécifiques a été choisi donnant un seul produit spécifique d'amplification de 673 pb contenant le SNP rs321 1908 du gène CD36. Mots clés: Obésité, Gène CD36, Amorces, rs321 1908, Produit spécifique. Summary: Introduction: Obesity is a major health problem that may contribute to the risk of metabolic complications Recent genetic studies suggest that CD36 plays an important sole in lipid metabolism in humans and may lie involved in the complications of the obesity. The CD36 isa scavenger receptor class B CD36 is a glycoprotein of 472 amino acids. The CD36 gene is located on chromosome 7q1 1.2 in humans. The protein is ubiquitously expressed on a variety ofcell types including adipocytes, macrophages, vascular endothelial oeils and intestinal enterocytes. Objective: The objective ofthis work is te design, with specificity, the primer flanking the SNP rs321 1908 in the CD36 gene associated with obesity in the European population torque. To swdy its involvement in obesity in the Algenan population during subsequent case-control study is being donc by PCR. 'Flic PCR (Polymerase Chain Reaction) amplifies a specific region in vitro nucleic acid given in order to obtain a sufficient quantity to detect and study Matenals airé Methods: The efficacy and sensitivity of PCR depend largely on the effectiveness of primers With software primer blast we designed a couple of specific primer to the region flanking the SNP ra 3211908. Results: A pair ofspecific primera was chosen giving a single specific amplification product 673 bp containing the SNP rs321 1908 in the CD36 gene. Keywords: Obesity, Gene CD36, Primera, rs321 1908, speciflcproduct. ' uU1J1 Ji-' CD36 .*i' ârLJ sJ1A. jCD36j4' t15 ti;, .1i 4I t.aiI e1i j1.. t • 14)) CD36 u-.,rs3211908 SNP a- 1 '—.,—'. J.J1 l :' ,Ic JjiI JJ . i i l 3l .1tlj PCR., .PCR 4111-9 -yu' j SNPiI &..,t 'UibIast primer -yh. J-'ii Li) PCR :J.,lIllj i r*f .CD36 8,irs321 1908 SNP ,,I 673pb', • t1.i ) e : ( ' .is321 1908 • Ainorces'CO36 :' '-