Etude de la résistance aux antibiotiques de Pseudomonas aeruginosa au niveau de différents hôpitaux de l’ouest algérien

Abstract

Année Universitaire: 2014-2015 Etude de la résistance aux antibiotiques de Pseudomonas aeruginosa au niveau de différents hôpitaux de l’ouest algérien ملخّص عصيّات Pseudomonas aeruginosa هي ج ا رثيم ممرضة انتهازية مسؤولة أساسا عن الالتهابات المكتسبة وتُظهر هذه البكتيريا قدرة التكيّف تجاه المضادّات الحيويّة ممّا يؤدّي إلى مشاكل علاجيّة حادّة في كثير من الأحيان. مجموع 217 جرثوم من عصيّات P. aeruginosa تمّ عزلها ما بين يناير 9002 ونوفمبر 2012 ، في مختلف الوحدات من ثلاثة مستشفيات جامعية في الغرب الج ا زئري. د ا رسة حساسيّة هذه الج ا رثيم إلى 12 مضادّ حيوي منهم 7  -لكتمين، 3 أمينوزيد، 1 فليوروكينولون والكولستين، تبيّن ظهور ج ا رثيم متعدّدة المقاومة للمضادّات الحيويّة. 92 (18%) كانت مقاومة للايميبينام (MICs ≥ 16 μg/ml) تم الكشف عن الجين 2 -VIMbla تشفير ميتالو -β-لاكتاماز في سلالتين . أظهرت السلالات المقاومة للايميبينام وجود طف ا رت في الجين oprD . تحليل السلالات بواسطة ال MLST ، اظهر وجود العديد من المستفردات الطبيعية الإستنساخية . ايضا، غالبية السلالات المقاومة تنتمي إلى ST244 نسخة دولية خطيرة . اظهرت السلالات التي تنتمي إلى نفس النسخة الوبائية وجود سلسلة الجين oprD متطابقة . هده الد ا رسة تمثل الكشف الثاني للميتالو -β- لاكتاماز VIM-2 في عام 9000 في سلالات P. aeruginosa في الج ا زئر . وجدنا أيضا أن الطف ا رت في الجين oprD هي الآلية الرئيسية لمقاومة الإيميبينام . اظهرنا أن الطف ا رت في الجين oprD يمكن أن تستخدم كأداة لد ا رسة الطبيعية الإستنساخية و قابلية التنسيل بين سلالات P. aeruginosa الكلمات المفتاحيّة: Pseudomonas aeruginosa ، مقاومة المضادّات الحيويّة، علم الأوبئة، الد ا رسة الجينية . RESUME Pseudomonas aeruginosa est une bactérie pathogène opportuniste responsable essentiellement d’infections nosocomiales. Cette espèce manifeste vis-à-vis des antibiotiques un pouvoir d'adaptation de plus en plus grand qui aboutit à des problèmes thérapeutiques souvent aigus. Un ensemble de 217 souches de P. aeruginosa ont été isolées, entre janvier 2009 et novembre 2012, au niveau de divers services de trois centres hospitalo-universitaires du nord-ouest algérien. L’étude de la sensibilité in vitro de ces germes vis-à-vis de 12 antibiotiques dont 7 β-lactamines, 3 aminosides, une fluoroquinolone et la colistine, par la méthode des disques selon les normes du CA-SFM, a révélé l’émergence de souches multirésistantes aux antibiotiques. 39 (18%) étaient résistantes à l’imipénème (CMI ≥16 μg / ml). Le gène blaVIM-2 codant une métallo-β-lactamase a été détecté chez deux souches. Les souches résistantes à l’imipénème ont montré la présence de mutations sur le gène oprD. L'analyse des souches par MLST a montré la présence de divers clones. De même, la majorité des souches résistantes appartenait au ST244, clone international à haut risque. Les souches appartenant au même clone épidémique présentaient une séquence du gène oprD identique. Nous rapportons la deuxième détection en 2010 de métallo-β-lactamaseVIM-2 chez les souches de P. aeruginosa en Algérie. Nous avons également constaté que les mutations oprD étaient le principal mécanisme de la résistance à l'imipénème. Nous démontrons que ces mutations oprD peuvent être utilisées comme un outil pour étudier la clonalité chez les souches de P. aeruginosa. MOTS CLES : Pseudomonas aeruginosa; résistance aux antibiotiques ; épidémiologie ; étude génotypique. SUMMARY Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen mainly responsible for nosocomial infections. These bacteria exhibit a big power of adapting for the antibiotics resulting in therapeutic problems often acute. A total of 217 strains of Pseudomonas aeruginosa were isolated between January 2009 and November 2012 from various units of three hospitals from western Algeria. The study in vitro of susceptibility of these organisms to 12 antibiotics, including 7 β-lactams, three aminoglycosides, one fluoroquinolone and colistin, revealed the emergence of antibiotics multiresistants strains. 39 (18%) were found to be resistant to imipenem (MICs ≥ 16 μg/ ml). The blaVIM-2 gene was detected in two strains. The remaining imipenem-resistant isolates showed the presence of oprD mutations. The MLST analysis differentiated strains into various clones and the strains from the same clone had an identical sequence of the oprD gene. The majority of resistant strains belonged to ST244 international high-risk clone. We report the second detection in 2010 of blaVIM-2 in Algerian P. aeruginosa strains. We also found that oprD mutations were the major determinant of high-level imipenem resistance. We demonstrate that these oprD mutations can be used as a tool to study the clonality in P. aeruginosa isolates. KEY WORDS: Pseudomonas aeruginosa; antibiotics resistance; epidemiology; genotyping