Conception des amorces encadrant le SNP rs6232 du gène PCSK1 associé à l'obésité

Abstract

L'obésite: est un trouble complexe fortement influencé par des facteurs génétiques et environnementaux. Il existe plusieurs gènes impliqués dans l'obésité parmi eux Le gène PCSK1 qui code pour une enzyme qui est responsable de la conversion de pro hormones en hormones impliquées dans la régulation du métabolisme énergétique. Ce qui implique que des variants commun du gène PCSKI pourrait prédisposer à l'obésité dans la population générale; le variant rs6234, le variant rs6235 et le variant rs6232 (T > C, N22 ID) ont été associé à l'obésité dans la population européenne. Ces études d'association se font grâce à l'outil important de réaction de polymérisation en chaine PCR. Dans la mise au point de la PCR, le choix d'amorces est crucial, plusieurs critères interviennent dans ce choix. Objectif: Nous allons concevoir, avec spécificité le couple d'amorce encadrant le SNP rs 6232 du gène PCSKI associé à l'obésité dans la population européenne. But: Le couple d'amorces conçue au cours de ce travail serviras à étudier l'implication du rs6232 dans l'obésité chez la population Algérienne; lors d'études ultérieurs cas-témoins. Matériels et méthodes: Recherche de la séquence de référence du gène PCSKI dans la base de données ensembl et utilisation du logiciel primer blast. Résultats: Un couple d'amorces spécifiques a été choisi donnant un seul produit spécifique d'amplification de 244pb contenant le SNP rs6232 Mots clés : Obésité, Gène PCSK1, Amorces, rs6232, Produit spécifique. Introduction: The obesity is a complex disorder strongly influenced by genetic and environmental factors. There are several genes involved in obesity among them PCSKI The gene which encodes an enzyme which is responsible for the conversion of prohormones into hormones involved in the regulation of energy metabolism. This implies that the common variants PCSK1 gene may predispose to obesity in the general population, the variant rs6234, rs6235variant and the variant rs6232 (T> C, N22 ID) were associated with obesity in the European population. These association studies are due to the important tool of polymerase chain reaction PCR. In the development of PCR, the choice of primers is crucial, several critena involved in the choice. Objective: We will design with the specific primer flanking the SNI? rs 6232 PCSK1 gene associated with obesity in the European population torque. Purpose: The pair ofprimers designed in this work serve to study the involvement of rs6232 in obesity in the Algenan population in subsequent case-control studies. Materials and Methods: Search the reference sequence of the gene in PCSK1 ensembi data base and using the software primer blast. Resuits: A pair of specific pnmers vas chosen giving a single specific amplification product containing the SNP rs6232 244pb Keywords: Obesity, Gene PCSK1, Primers, rs6232, specific product