Caractérisation génétique animal et identification des régions associées aux phénotypes

Abstract

e domaine de la production de l’élevage connais un chamboulement tant qu’il causerait une augmentation de nouveaux pathogènes qui se développent et se propagent de l’animal à l’homme à l’échelle mondiale. Nous avons trouvé une étroite corrélation entre la santé animale, humaine et l’environnement. De ce fait la description récente de la maladie à prion du chameau (CPrD) en Algérie et en Tunisie et le soupçon qu'elle rentre dans la catégorie des maladies infectieuses à prion, rend urgent d'enquêter sur l'existence éventuelle de déterminants génétiques utiles pour sa lutte. Ici, nous avons étudié la variabilité du PRNP chez 232 animaux de six populations de dromadaires (Azawad n=38, Hybride n= 13, Naili n= 23, Rguibi n= 56, Sahraoui n= 16, Targui n= 86) d'Algérie, avec d’abord une extraction d’ADN du sang total s’ensuit le séquençage des échantillons d’ADN. Une mutation Gly69Ser a été observée chez un seul animal de la population Targui et un polymorphisme Gly134Glu dans les populations Azawad, Hybride et Rguibi, avec une fréquence de l'allèle 134Glu de 1,3%, 3,8% et 3,6%, respectivement. Bien que nos travaux mettent en évidence une faible variabilité du PRNP dromadaire algérien, comme indication possible d'une histoire évolutive récente de CPrD, ils offrent également la preuve d'un variant du PRNP dans une région critique de la PrP dont le rôle dans la résistance / susceptibilité aux maladies à prions mérite d'être approfondi. Une étude morphometrique a été établie pour but de comparaison entre les populations dromadaire. La caractérisation des données établie par Gherissi, Cherifi, Kaouadji et Meghelli à paramètres qualitatifs (région géographique, âge, sexe, couleur de la robe) de plusieurs populations (Targui n=22, Naili n=55, Rguibi n=21, Azawad n=15, Sahraoui n=99, Chaambi n=42 et Hybride n=15). Ainsi qu’une caractérisation réalisée sur une population Sahraoui ,avec un total de 188 individus, au niveau de plusieurs régions d’Algérie (El Oued, Ghardaïa, Ouargla, El Mnia), a paramètres quantitatifs étudié sont la région géographique, la circonférence abdominal CA, la circonférence thoracique CT, la hauteur au garrot HG et estimation du poids.

Mots clé : Algérie, Population dromadaire, PRNP, CPD, caractérisation morphometrique.