Caractérisation De Souches d’Enterococcus Sp. Isolées Du Centre Hospitalo-Universitaire De Tlemcen Et Etude De Leur Antibiorésistance

Abstract

يستمر جينvanA في االنتشار في جميع أنحاء العالم. ال يبدو أن الجزائر بمنأى عن ذلك ، لكن البيانات ، التي ال تزال متفرقة ،وقديمة أي ًضا. وقد برر هذا االهتمام المهيمن في استكشاف الحالة الحالية لمقاومة المضادات الحيوية فيEnterococci ، مع التركيز على وجود جينات معينة. دراسة تواتر العزل ومستوى مقاومة المضادات الحيوية للمكورات المعوية البرازية faecalis Enterococcus و faecium Enterococcusالمعزولة خالل عامين في مستشفى تلمسان )شمال غرب الجزائر( ، أثناء التحقيق في احتمال وجود المكورات المعوية(VRE (مادة مقاومة للفانكومايسين . الدراسة الحالية عبارة عن دراسة استطالعية تم فيها عزل spp Enterococcus من خمسة أقسام مختلفة تم تحديدها وتأكيدها من E. و E. faecium 47 (42%), E. avium 2 (1.8%) , E. faecalis 59 (53%) "tuf": لجين الجزيئي التعريف خالل 3 durans( 7.2 .)%تم إجراء حساسية المضادات الحيوية عن طريق طريقة انتشار األجار وطريقة الحد األدنى من التركيز المثبط .(MIC(تم البحث عن جينات مقاومة الفانكومايسين vanA و vanB عن طريق تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR (ثم تم تحديد تسلسلها بواسطة مختبر Genoscreen في ليل )فرنسا(. تم استخدام اإلصدار 20 من برنامج) SPSS حزمة IBM اإلحصائية إلحصاءات العلوم االجتماعية (20) SPSS (لتحليل البيانات التي تم الحصول عليها من الدراسة. أظهر تفاعل البوليميراز المتسلسل للجين "tuf "نوعين سائدين هما faecalis. E و faecium E تتمتع جميع العزالت بمقاومة متعددة لألدوية ، وقد تميز اثنان من faecium. E بمقاومتهما للفانكومايسين مع 256> MICs ميكروغرام/مل. في أصل هذه المقاومة ، تم توصيف جين vanA وتسلسله ؛ تم إدخال التسلسل الذي تم الحصول عليه في قاعدة بيانات for Genbank National Center Biotechnology Information (NCBI) كشف هذا العمل عن مستويات مثيرة للقلق من مقاومة المضادات الحيوية في المكورات المعوية، تم العثور على جين vanA في اثنين من faecium. E كشف تسلسل هذا الجين عن تماثل كامل مع آخر معزول في كوبا ، مما يدل على انتشار عالمي لهذا الجين المقاوم. الكلمات الدليلية:CHU ، مضاد حيوي، Enterococci ،مقاومة،vanA. Résumé Le gène vanA continue de se propager dans le monde. L'Algérie ne semble pas être épargnée, mais les données, qui restent sporadiques, sont également anciennes. Cela a justifié l'intérêt d'explorer l'état actuel de la résistance aux antibiotiques chez les entérocoques, tout en se concentrant sur la présence de certains gènes. Etudier la fréquence d'isolement et le niveau de résistance aux antibiotiques d'Enterococcus faecalis et Enterococcus faecium isolés pendant deux ans à l'hôpital de Tlemcen (nord-ouest de l'Algérie), tout en recherchant la présence éventuelle des gènes de résistance à la Vancomycine. Cette étude prospective dans laquelle Enterococcus spp a été isolé de cinq services différents, quatre espèces ont été identifiées et confirmées par identification moléculaire du gène «tuf» E. faecalis 59 (53%), E. faecium 47 (42%), E. avium 2 (1.8%) et E. durans 3 (2.7%). La sensibilité aux antibiotiques a été réalisée par la diffusion sur gélose et la méthode de concentration minimale inhibitrice (CMI). Les gènes de résistance à la vancomycine (vanA, vanB) ont été recherchés par Réaction de Polymérisation en Chaine (PCR) puis séquencés par le laboratoire Genoscreen à Lille (France). Le logiciel SPSS version 20 (IBM Statistical Package for the Social Sciences (SPSS) statistics 20) a été utilisé pour analyser les données issues de l'étude. La PCR du gène « tuf » a révélé deux espèces prédominantes E. faecalis et E. faecium. Tous les isolats ont une multirésistance, deux E. faecium ont été distingués par leur résistance à la vancomycine avec des CMI> 256 μg /mL. A l'origine de cette résistance, le gène vanA a été caractérisé et séquencé ; la séquence obtenue a été introduite dans la base de données du Genbank National Center for Biotechnology Information (NCBI). Ces travaux ont révélé des niveaux alarmants de résistance aux antibiotiques chez les entérocoques, le gène vanA a été retrouvé chez deux E. faecium ; le séquençage de ce gène a révélé une homologie totale avec un autre isolat à Cuba, ce qui démontre une diffusion mondiale de ce gène de résistance. Mots-clés : CHU, Antibiotique, Enterococcus, Résistance, vanA. ABSTRACT The vanA gene continues to spread throughout the world. Algeria does not seem to be spared, but the data, which remain sporadic, are also old. This has justified the overriding interest in exploring the current state of antibiotic resistance in Enterococci, while focusing on the presence of certain genes. To study the isolation frequency and the level of antibiotic resistance of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium isolated during two years at the Tlemcen Hospital (northwest Algeria), while investigating the possible presence of Vancomycin Resistant Enterococci (VRE). The present study was a prospective study in which Enterococcus spp was isolated from five different departments, four species were identified and confirmed by molecular identification with ‘tuf’ gene: E. faecalis 59 (53%), E. faecium 47 (42%), E. avium 2 (1.8%) and E. durans 3 (2.7%). Antibiotic sensitivity was done by the agar diffusion and Minimum Inhibitory Concentration (MIC) method. The vancomycin resistance genes (vanA, vanB) were researched by Polymerase Chain Reaction (PCR) and then sequenced by the Genoscreen laboratory in Lille (France). SPSS software version 20 (IBM Statistical Package for the Social Sciences (SPSS) statistics 20) was used to analyse the data obtained from the study. The PCR of the “tuf” gene revealed two predominant species E. faecalis and E. faecium. All isolates have a multidrug resistance, two E. faecium were distinguished by their resistance to vancomycin with MICs >256 μg/mL. At the origin of this resistance, the vanA gene was characterised and sequenced; the obtained sequence has been introduced into the Genbank National Center for Biotechnology Information (NCBI) database. This work revealed alarming levels of antibiotic resistance in Enterococci, the vanA gene was found in two E. faecium; sequencing of this gene has revealed a total homology with another isolated in Cuba, which demonstrates a worldwide spread of this resistance gene. Keywords : CHU, Antibiotic, Enterococci, Resistance, vanA.